在自然感染情况下总是先有病毒，后有抗体，即先有HCVRNA，后有HCV抗体，后者一般在感染病毒后4～32周出现。抗体存在的时间较长，即使病毒已被清除，HCV抗体仍会持续一段时间，并且可以通过输血和血液制品进入他人体内，母体的HCV抗体也能通过胎盘进入胎儿体内。简言之，HCVRNA阳性说明体内有丙型肝炎病毒复制，单纯HCV抗体阳性仅表示感染过丙型肝炎病毒，或从他人获得了HCV抗体。
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