虽然丙型肝炎临床症状相对较轻，但易向慢性化转变，转氨酶常呈波浪起伏升高，持续达６个月者（占５７％）比乙肝（占２８％）更为多见。长潜伏期和轻型或无黄疸者，易发展为慢性，女性较男性易发展为慢性。经皮传播者，特别是输血后丙型肝炎较非肠道外传播者更易发展为慢性。据报告，输血后丙型肝炎慢性化频率高达４０％－６０％，而且，大多数形态学改变为慢性活动性肝炎，其中１０％－２０％发生肝硬化，有时在急性起病后几个月至１年内，在无症状的情况下，不知不觉地演变为肝硬化，而且，少数患者病情迅速发展，最后死亡。
丙型肝炎的一种最常见的类型，是在生化和组织学初次康复２－３年后，又出现转氨酶缓慢升高或间歇升高，容易忽略而不被发现，最后多数演变为慢性肝炎和肝硬化。
丙型肝炎的高危人群是指经常肠道外暴露血淬得，如血友病患者、静脉内滥用药物成瘾者、血液透析患者、骨髓和肾移植患者、心外科患者以及经常经皮注射的患者。据来自西班牙的报告，血友病患者、静脉内滥用药物成瘾者及血液透析患者，丙型肝炎病毒抗体阳性率分别为６４％、７０％及２０％，较一般人群明显为高。
最近美国报道２３１例中，从输血到发生慢性肝炎４５例丙肝抗体阳性者的平均时间为１０年；从输血到发生肝硬化的２３例丙肝抗体阳性者的平均时间为２１．２年；从输血到肝癌的２１例丙肝抗体阳性者的平均时间为２９年。