丙型肝炎是由丙型肝炎病毒（HCV）引起的。至于其发生的机理，目前尚不明确。但实验研究表明：丙型肝炎的肝脏病变部位有多数单核细胞浸润，发生炎症和坏死，这和HBV引起的肝脏病变相似。同时，感染HCV后，也和HBV感染一样容易发生慢性肝炎、肝硬化和肝癌。这就说明，HCV感染引起的肝脏病变也和HBV感染相似，主要由病毒诱发人体免疫反应导致对肝细胞的兔疫损伤。而通过输血和应用血制品引起的传播也已确定无疑。此外，针刺、滥用注射药物、纹身、粪口途径、母婴垂直传播，以及唾液、飞沫、接吻和性接触等水平传播，也是引起丙型肝炎的可能原因。
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