2012年（2012年1月1日零时至12月31日24时），全国（不含台港澳，下同）共报告法定传染病发病6951478例，死亡17315人，报告发病率为515.94/10万，死亡率为1./10万。

2012年，全国共报告甲类传染病发病76例，死亡1人，报告发病率为0.06/10万，比2011年上升194.74%，死亡率为0.0001/10万，与2011年持平。乙类传染病除传染性非典型肺炎、脊髓灰质炎和白喉无发病、死亡报告外，其它共报告发病3216856例，死亡16720人。报告发病率为238.75/10万，死亡率为1.24/10万，分别较2011年下降1.66%和上升9.02%（既往已报告的HIV感染者转化艾滋病病例为新增纳入发布数据，2012年度不参与报告发病率同期比）。报告发病数居前五位的病种依次为病毒性肝炎、肺结核、梅毒、细菌性和阿米巴性痢疾及淋病，占乙类传染病报告发病总数的94.55%，报告死亡数居前五位的病种依次为艾滋病、肺结核、狂犬病、病毒性肝炎和流行性出血热，占乙类传染病报告死亡总数的98.38%。

同期，丙类传染病共报告发病3734546例，死亡594人，报告发病率为277.18/10万，死亡率为0.04/10万，分别较2011年上升20.57%和9.98％。报告发病数居前五位的病种依次为手足口病、其它感染性腹泻病、流行性腮腺炎、流行性感冒和风疹，占丙类报告发病总数的98.97%。报告死亡数较多的为手足口病和其它感染性腹泻病。

与2011年相比，2012年甲乙类传染病中的肠道传染病、呼吸道传染病报告发病率分别下降12.62%和3.50%，自然疫源及虫媒传染病、血源及性传播传染病报告发病率分别上升3.78%和1.42%（既往已报告的HIV感染者转化艾滋病病例为新增纳入发布数据，2012年度不参与报告发病率同期比）。肠道传染病中除霍乱和伤寒/副伤寒报告发病率上升外，脊髓灰质炎、甲型肝炎、细菌性和阿米巴性痢疾、未分型肝炎和戊型肝炎报告发病率均有所下降；呼吸道传染病中传染性非典型肺炎和白喉无发病、死亡病例报告，甲型H1N1流感、麻疹、猩红热、流行性脑脊髓膜炎、百日咳和肺结核报告发病率均有所下降；自然疫源及虫媒传染病中登革热、流行性出血热、钩端螺旋体病、流行性乙型脑炎、血吸虫病和布鲁氏菌病报告发病率有不同程度上升，鼠疫和人感染高致病性禽流感（各1例）与2011年相同，疟疾、狂犬病和炭疽报告发病率有所下降；血源及性传播传染病中丙型肝炎、艾滋病和梅毒报告发病率有所上升，淋病和乙型肝炎报告发病率出现下降。

2012年全国共报告人间鼠疫发病1例，死亡1人，报告发病数和死亡数均与2011年相同；共报告霍乱发病75例，无死亡，报告发病率为0.006/10万，较2011年上升211.11%；报告人感染高致病性禽流感发病1例，死亡1人，报告发病数和死亡数均与2011年相同。