绝大多数慢性脂肪肝预后良好，如能早期诊治，可以阻止脂肪肝的进一步发展，尤其是单纯性脂肪肝，消除病因后，可使其逐渐恢复，甚至使其逆转。但有些如四环素、黄磷中毒、妊娠等引起的急性脂肪肝，预后险恶，死亡率很高。
病毒性肝炎合并脂肪肝时，其预后基本上取决于病毒性肝炎本身的病情进展。由于脂肪肝可以使机体脂类代谢异常，能量代谢发生紊乱，从而降低了机体对细菌、病毒的清除和防御能力，可加重原有疾病。因此设法消除脂肪肝，有助于恢复机体的消化功能和肝功能，有利于恢复健康。
脂肪肝一般在短期内不至于发展为肝硬化，但如果脂肪肝病情较重，肝功能损害明显，则有可能向肝纤维化和肝硬化发展，如果发展成为肝纤维化或肝硬化，则其预后与一般的门脉性肝硬化相同。
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