小肠改道手术、胃成形术治疗肥胖症、胆胰改道手术以及广泛小肠切除等外科手术也可引起脂肪肝，肝内脂肪沉积增加常发生于手术后6个月内，以后渐减，直至改道手术的2～3年后。它主要是脂肪组织中脂肪酸被动用之故，这类患者血液内必需氨基酸含量也降低，它与蛋白质–热量不足的营养不良所见相似，细菌毒素和石胆酸也可能起不良作用，这或许可解释所伴随的肝坏死与纤维化。重新吻合肠道，恢复肠道正常走向，并补充必需氨基酸，可使肝内脂肪堆积消退。
此外，外科手术后患者高脂肪高热量饮食，并限制活动，可引起短期内体重明显增加，并导致脂肪肝。因此，术后营养补给不要过度，并尽早适当运动及术后保健，保持大便通畅，以利于体力恢复和维持理想体重，从而预防脂肪肝等营养过剩性疾病的发生。
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